Melissani, ač je nazýváno jezerem, jde ve skutečnosti o jeskynní lagunu s až neskutečně tyrkysovou barvou vody. Vodní plocha je dlouhá jen 150 metrů a návštěvníci se po ní mohou projet na lodičkách. Světlo a sluneční paprsky, které procházejí skaliskem až dolů na hladinu, vytváří neopakovatelnou mystickou atmosféru tohoto místa.

Ač existence Melissani byla známa po staletí, vědecký průzkum tu započal až v 50. letech 20. století, přičemž zpřístupněna veřejnosti byla až v 60. letech. Nálezy zde objevené dokazují, že o tomto úkrytu věděli už lidé před více než 2 000 lety. Šlo hlavně o hliněné desky s malbami a nápisy, které jsou dnes k vidění v Archeologickém muzeu v hlavním městě ostrova.